La Clínica San Fermín fue fundada en Pamplona en el año 1941 por el Dr. Don Arturo Arrondo López y por su esposa Doña Mª Jacinta Ayestarán Garro.
En sus comienzos tenía una capacidad de 8 camas y estaba dedicada a Cirugía General. En sucesivos años (1947, 1952 y 1962) la capacidad de la Clínica aumentó y en el año 1971 alcanza las 72 camas.
Con la aparición de las especializaciones, Clínica San Fermín centró sus esfuerzos en Traumatología, Ortopedia y Rehabilitación, Obstetricia y Ginecología, Urología, Otorrinolaringología y Cirugía Plástica.
En el año 1984 se destina una parte de sus instalaciones a la atención de personas en situación de dependencia, compaginando la labor de la clínica previamente establecida.